奎屯仁慈医院设置的诊疗科目有：内科，骨科，小儿骨科，创伤急诊科，康复医学科，麻醉科，医学检验科，中医骨伤科，中医康复，泌尿外科，医疗技术咨询服务等十于个科室。设置标准洁净层流手术室、配备完善、功能齐全，是奎屯市条件较好的手术室；康复理疗科，康复器具齐全，能帮助患者尽早恢复功能；医学实验室具有较好的实验设备，为医学基础研究、创新科研、教学提供了学术环境；多功能学术会议厅，可供院内外学术交流、举办专业学习班及其它会议活动。